Thật ra không có hạt giống nào thích bị đẫm nước. Bởi vì nếu tình trạng này kéo dài hạt sẽ bị thiếu oxy để hô hấp, đặc biệt ở các loại hạt “yếu” trong khi hàm lượng tinh bột lại cao như dưa leo, đậu. Hạt yếu được hiểu là hạt có sức sống kém, do được lưu trữ lâu hoặc lưu trữ trong điều kiện không thuận lợi, hạt bị thu hoạch quá sớm hay quá trình phát triển hạt trong trái bị ảnh hưởng tiêu cực do côn trùng sâu bệnh và thời tiết bất lợi. Vì vậy, chỉ với một lượng nhỏ oxy, có thể không đủ để khơi mào cho hoạt động phân giải tinh bột, protein và chất béo cần thiết trước khi tế bào hạt có thể giải phóng năng lượng để dùng vào các hoạt động trao đổi chất khác. Lúc này, hạt sẽ bị “chết ngạt”, dẫn đến tình trạng thối hạt.

Ngâm hạt trong nước ấm, ngoài việc để kích thích hạt nảy mầm đồng đều và cho cây giống khỏe mạnh, còn giúp loại bỏ bớt một số hạt lép nổi bên trên (trường hợp hạt giống được giữ từ vụ trước và không qua các giai đoạn xử lý chuyên nghiệp như ở công ty), thường thấy ở hạt hoa hướng dương, dưa lưới. Tuy vậy, cũng đừng lẫn lộn sự nổi của các hạt lép và hạt bình thường do chưa được thấm nước đầy đủ. Một số hạt vẫn còn một ít khoảng trống giữa phần thịt hạt và lớp vỏ hạt (do đặc tính hạt hoặc do chất lượng hạt kém, thịt không đầy). Khi hạt chưa đẫm nước, phần khí bên trong giúp hạt nổi lên.